Genoma de referencia de Calasterella californica
Image by CHUTTERSNAP
Como parte del California Conservation Genomics Project, estamos estudiando la diversidad genética de Calasterella californica. El primer paso para lograr este objetivo fue ensamblar de novo un genoma de referencia.
El ensamble está disponible en NCBI (AstCali1) bajo el nombre Asterella californica, que corresponde al nombre usado para esta especie antes de su transferencia al nuevo género Calasterella.
Aquí ponemos a disposición la anotación de este genoma de referencia, basada en evidencia transcriptómica y de homología.
Descargas
Descarga aquí los archivos de anotación. Este directorio comprimido incluye:
- Archivo FASTA de CDS.
- Archivo FASTA de genes.
- Archivo GFF3 de anotación.
- Archivo FAA de proteínas.
Citas relevantes
- González-Ramírez, I.S., Escalona, M., Miller, C., Chumchim, N., Marimuthu, M.P., Nguyen, O., Song, M.J. and Mishler, B.D., 2025. A genome assembly for the California endemic liverwort Calasterella californica. Journal of Heredity, 116(3), pp.389-396.